Κατά τον σεισμό της 07/09/1999, οι κτιριακές του εγκαταστάσεις καταστράφηκαν πλήρως και το γεγονός επέβαλε την διάσπαση των τμημάτων του Νοσοκομείου και την μεταφορά του ανθρώπινου δυναμικού, του εξοπλισμού και των δραστηριοτήτων του σε άλλα νοσοκομεία.